药用植物生理生态研究所成立于2019年11月，学术带头人为王宏斌教授（国家杰出青年科学基金获得者、万人计划科技创新领军人才），现有固定专业技术人员6人，成员学科方向多元互补，多学科交叉特色明显。建设有基因组学、蛋白质组学、代谢组学以及药用植物学研究平台等，配置了超高效液相色谱四级杆飞行时间质谱联用仪等各种大型配套设备，建设了占地约1200㎡的药用植物研究培养与种植繁育一体化平台（分别可实现全人工控制、半人工控制以及自然条件模拟），还建有植物组织培养室。

本研究所对中药资源学的核心理论与应用问题——道地性、生理与代谢调控、遗传资源开发等进行科研攻关，凝练了“药用植物资源”“药用植物代谢途径解析”“药用植物生理”“药用植物组学解析”四个研究方向，目前研究对象聚焦在大宗、名贵及岭南道地药材，包括穿心莲、金银花、石斛、巴戟天、广藿香、紫苏等。成立以来，共承担纵向科研项目17项，累计科研经费近千万元，其中王宏斌教授获批广东省普通高校创新团队项目“药用植物生理生态研究团队”（2020年）、国家自然科学基金联合基金项目（2022年），靳红磊教授获批广东省特支计划青年拔尖人才项目（2019年）、国家自然科学基金优秀青年科学基金（2023年）等。

已在 Nature Communications（2篇）、Journal of Integrative Plant Biology（2篇）、Cell Reports（2篇）、Plant Physiology、Plant Journal（2篇）、Engineering等国际知名期刊发表论文20余篇，获国家授权专利4项，审定新品种4项，荣获2022年度广东省科学技术奖自然科学奖二等奖。

本所承担中药学院本科生《分子生物学》《细胞生物学》《药用植物学》，以及研究生《分子生物学》和《本草基因组学》等课程教学工作。此外，本所实验室对本科生开放，并积极指导学生创新创业活动。