研究领域：计算药物化学

(1) 天然产物生物合成 聚焦于活性天然产物生物合成关键酶的结构与功能，综合运用分子建模、分子动力学（MD）模拟和量子-经典力学(QM/MM)等多尺度计算模拟方法，解析酶催化机制与调控因素，指导酶的理性设计功能改造。

(2) 生物酶催化体系理论研究与酶设计

(3) 药物-靶点相互作用

1.国家自然基金青年科学基金项目，22103098，人参三萜环化酶PgPNA/PgPNY催化机制研究与突变体酶设计，2022/1-2023/12，20万元，在研，主持。

2. 中国博士后科学基金会，第 2 批特别资助（站前），2020TQ0390，萜类天然产物合成酶的催化机制研究及酶蛋白设计改造，2020/07-2022/06, 18 万，结题，主持。

3. 中国博士后科学基金会，第 68 批面上资助， 2020M683114，活性五环三萜化合物合成酶催化机制研究与催化活性改造，2020/11-2022/06, 8 万，结题，主持。

主要承担《药物设计学》、《物理化学》等课程。

• 1. Fan Zhang^#; Yunpeng Wang^#; Jingyang Yue; Rongrong Zhang; Yong-er Hu; Ruoshi Huang; Ai-jia Ji; B. Andes Hess Jr.; Zhongqiu Liu*; Lixin Duan*; Ruibo Wu* Discovering a Uniform Functional Trade-off of the CBC-type 2,3-Oxidosqualene Cyclases and Deciphering its Chemical Logic. Sci. Adv. 2023, 9, eadh1418.

• 2. Fan Zhang, Tao Zeng, Ruibo Wu^*. QM/MM Modeling Aided Enzyme Engineering in Natural Products Biosynthesis. J. Chem. Inf. Model. 2023, 63, 16, 5018–5034.

• 3. Wenlong Zha^#; Fan Zhang^#(co-first author); Jiaqi Shao; Xingmei Ma; Jianxun Zhu; Pinghua Sun; Ruibo Wu*; Jiachen Zi* Rationally engineering santalene synthase to readjust the component ratio of sandalwood oil. Nat. Commun. 2022,13, 2508.

• 4. Miaomiao Liang.^#; Fan Zhang^#(co-first author); Jiaxin Xu; Xiaoning Wang; Ruibo Wu*; Zheyong Xue* A conserved mechanism affecting hydride shifting and deprotonation in the synthesis of hopane-type triterpenes as compositions of surface wax in oat. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2022, 119, e2118709119.

• 5. Fan Zhang^#; Tianyue An^#; Xiaowen Tang; Jiachen Zi*; Hai-Bin Luo*; Ruibo Wu* Enzyme Promiscuity versus Fidelity in Two Sesquiterpene Cyclases (TEAS versus ATAS). ACS Catal. 2020, 10, 1470-1484.

• 6. Shidan Wu^#; Fan Zhang^#(co-first author); Wenbo Xiong; István Molnár; Jincai Liang; Ai-jia Ji; Yu Li; Caixia Wang; Shengliang Wang; Zhongqiu Liu*; Ruibo Wu*; Lixin Duan* An Unexpected Oxidosqualene Cyclase Active Site Architecture in the Iris tectorum Multifunctional α-Amyrin Synthase. ACS Catal. 2020, 10, 9515-9520.