广州中医药大学于1976年开办中药班，并于1977年开始招收中药学专业本科班，1984年在中药学专业的基础上成立中药系，1997年经国家中医药管理局批准更名为“中药学院”，2004年成立了中药学院党委 ，2006年与广州中医药大学新药中心实行合署办公的管理机制，并更名为“中药学院（新药开发研究中心）”。学校于1993年成立新药开发研究中心（简称新药中心）。现中药学院与新药中心实行合署办公的管理机制。

中药学院党委坚持固本强基工程，加强党支部建设和发展党员工作，至2011年学院共有23个党支部，652名党员，共举办了20期党校培训班， 其中2011年培养学生238名,发展党员115名。